Ignore:
Timestamp:
Apr 10, 2018, 6:43:31 AM (7 years ago)
Author:
Frederik Heber <frederik.heber@…>
Branches:
AutomationFragmentation_failures, Candidate_v1.6.1, ChemicalSpaceEvaluator, Exclude_Hydrogens_annealWithBondGraph, ForceAnnealing_with_BondGraph, ForceAnnealing_with_BondGraph_contraction-expansion, Gui_displays_atomic_force_velocity, PythonUI_with_named_parameters, StoppableMakroAction, TremoloParser_IncreasedPrecision
Children:
8450da
Parents:
0c4f24
git-author:
Frederik Heber <frederik.heber@…> (08/02/17 21:56:13)
git-committer:
Frederik Heber <frederik.heber@…> (04/10/18 06:43:31)
Message:

TESTFIX: Fixes to Python tests due to changed anneal() and modified way of trajectory steps usage.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • tests/Python/ForceAnnealing/post/five_carbon_test_bondgraph.data

    r0c4f24 r90ece9  
    22# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    33C       1       6       10      10      0       0       0       0       0       0       2       0       0       0       
    4 C       2       7.6     10      10      0       0       0       0       0       0       1       3       0       0       
    5 C       3       8.7     10      10      0       0       0       0       0       0       2       4       0       0       
    6 C       4       10.8    10      10      0       0       0       0       0       0       3       5       0       0       
     4C       2       7.6     10      10      0       0       0       -0.264589       0       0       1       3       0       0       
     5C       3       8.7     10      10      0       0       0       0.529177        0       0       2       4       0       0       
     6C       4       10.8    10      10      0       0       0       -0.264589       0       0       3       5       0       0       
    77C       5       12.4    10      10      0       0       0       0       0       0       4       0       0       0       
    88# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    9 C       1       6       10      10      0       0       0       0       0       0       2       0       0       0       
    10 C       2       7.57354 10      10      0       0       0       -0.264589       0       0       1       3       0       0       
    11 C       3       8.75292 10      10      0       0       0       0.529177        0       0       2       4       0       0       
    12 C       4       10.7735 10      10      0       0       0       -0.264589       0       0       3       5       0       0       
    13 C       5       12.4    10      10      0       0       0       0       0       0       4       0       0       0       
     9C       1       6       10      10      0       0       0       -0.014002       0       0       2       0       0       0       
     10C       2       7.57354 10      10      0       0       0       -0.208581       0       0       1       3       0       0       
     11C       3       8.75292 10      10      0       0       0       0.445144        0       0       2       4       0       0       
     12C       4       10.7735 10      10      0       0       0       -0.208538       0       0       3       5       0       0       
     13C       5       12.4    10      10      0       0       0       -0.0140232      0       0       4       0       0       0       
    1414# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    15 C       1       5.97149 10      10      0       0       0       -0.014002       0       0       2       0       0       0       
    16 C       2       7.49973 10      10      0       0       0       -0.208581       0       0       1       3       0       0       
    17 C       3       8.95748 10      10      0       0       0       0.445144        0       0       2       4       0       0       
    18 C       4       10.6998 10      10      0       0       0       -0.208538       0       0       3       5       0       0       
    19 C       5       12.3715 10      10      0       0       0       -0.0140232      0       0       4       0       0       0       
     15C       1       5.97149 10      10      0       0       0       -0.0379738      0       0       2       0       0       0       
     16C       2       7.49973 10      10      0       0       0       -0.0373017      0       0       1       3       0       0       
     17C       3       8.95748 10      10      0       0       0       0.150588        0       0       2       4       0       0       
     18C       4       10.6998 10      10      0       0       0       -0.0373705      0       0       3       5       0       0       
     19C       5       12.3715 10      10      0       0       0       -0.037942       0       0       4       0       0       0       
    2020# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    21 C       1       5.93924 10      10      0       0       0       -0.0379738      0       0       2       0       0       0       
    22 C       2       7.49102 10      10      0       0       0       -0.0373017      0       0       1       3       0       0       
    23 C       3       9.03941 10      10      0       0       0       0.150588        0       0       2       4       0       0       
    24 C       4       10.6911 10      10      0       0       0       -0.0373705      0       0       3       5       0       0       
    25 C       5       12.3392 10      10      0       0       0       -0.037942       0       0       4       0       0       0       
     21C       1       5.93924 10      10      0       0       0       -0.0255169      0       0       2       0       0       0       
     22C       2       7.49102 10      10      0       0       0       -0.00179391     0       0       1       3       0       0       
     23C       3       9.03941 10      10      0       0       0       0.054664        0       0       2       4       0       0       
     24C       4       10.6911 10      10      0       0       0       -0.00189975     0       0       3       5       0       0       
     25C       5       12.3392 10      10      0       0       0       -0.0254534      0       0       4       0       0       0       
    2626# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    27 C       1       5.90802 10      10      0       0       0       -0.0255169      0       0       2       0       0       0       
    28 C       2       7.49975 10      10      0       0       0       -0.00179391     0       0       1       3       0       0       
    29 C       3       9.08428 10      10      0       0       0       0.054664        0       0       2       4       0       0       
    30 C       4       10.6998 10      10      0       0       0       -0.00189975     0       0       3       5       0       0       
    31 C       5       12.3082 10      10      0       0       0       -0.0254534      0       0       4       0       0       0       
     27C       1       5.90802 10      10      0       0       0       -0.0043763      0       0       2       0       0       0       
     28C       2       7.49975 10      10      0       0       0       -0.00381008     0       0       1       3       0       0       
     29C       3       9.08428 10      10      0       0       0       0.0163992       0       0       2       4       0       0       
     30C       4       10.6998 10      10      0       0       0       -0.00376774     0       0       3       5       0       0       
     31C       5       12.3082 10      10      0       0       0       -0.00444509     0       0       4       0       0       0       
    3232# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    33 C       1       5.90803 10      10      0       0       0       -0.0043763      0       0       2       0       0       0       
    34 C       2       7.49176 10      10      0       0       0       -0.00381008     0       0       1       3       0       0       
    35 C       3       9.10147 10      10      0       0       0       0.0163992       0       0       2       4       0       0       
    36 C       4       10.6908 10      10      0       0       0       -0.00376774     0       0       3       5       0       0       
    37 C       5       12.3079 10      10      0       0       0       -0.00444509     0       0       4       0       0       0       
     33C       1       5.90803 10      10      0       0       0       -0.00860971     0       0       2       0       0       0       
     34C       2       7.49176 10      10      0       0       0       0.013748        0       0       1       3       0       0       
     35C       3       9.10147 10      10      0       0       0       -0.0107846      0       0       2       4       0       0       
     36C       4       10.6908 10      10      0       0       0       0.0146953       0       0       3       5       0       0       
     37C       5       12.3079 10      10      0       0       0       -0.00904893     0       0       4       0       0       0       
    3838# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    39 C       1       5.90707 10      10      0       0       0       -0.00860971     0       0       2       0       0       0       
    40 C       2       7.49521 10      10      0       0       0       0.013748        0       0       1       3       0       0       
    41 C       3       9.09579 10      10      0       0       0       -0.0107846      0       0       2       4       0       0       
    42 C       4       10.6951 10      10      0       0       0       0.0146953       0       0       3       5       0       0       
    43 C       5       12.3069 10      10      0       0       0       -0.00904893     0       0       4       0       0       0       
     39C       1       5.90707 10      10      0       0       0       -0.00627604     0       0       2       0       0       0       
     40C       2       7.49521 10      10      0       0       0       0.00658296      0       0       1       3       0       0       
     41C       3       9.09579 10      10      0       0       0       -0.000672055    0       0       2       4       0       0       
     42C       4       10.6951 10      10      0       0       0       0.00660942      0       0       3       5       0       0       
     43C       5       12.3069 10      10      0       0       0       -0.00624429     0       0       4       0       0       0       
    4444# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    45 C       1       5.90506 10      10      0       0       0       -0.00627604     0       0       2       0       0       0       
    46 C       2       7.49716 10      10      0       0       0       0.00658296      0       0       1       3       0       0       
    47 C       3       9.09547 10      10      0       0       0       -0.000672055    0       0       2       4       0       0       
    48 C       4       10.6973 10      10      0       0       0       0.00660942      0       0       3       5       0       0       
    49 C       5       12.305  10      10      0       0       0       -0.00624429     0       0       4       0       0       0       
     45C       1       5.90506 10      10      0       0       0       -0.0041805      0       0       2       0       0       0       
     46C       2       7.49716 10      10      0       0       0       0.00328619      0       0       1       3       0       0       
     47C       3       9.09547 10      10      0       0       0       0.0018627       0       0       2       4       0       0       
     48C       4       10.6973 10      10      0       0       0       0.00310627      0       0       3       5       0       0       
     49C       5       12.305  10      10      0       0       0       -0.00407466     0       0       4       0       0       0       
    5050# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    51 C       1       5.90296 10      10      0       0       0       -0.0041805      0       0       2       0       0       0       
    52 C       2       7.4988  10      10      0       0       0       0.00328619      0       0       1       3       0       0       
    53 C       3       9.09605 10      10      0       0       0       0.0018627       0       0       2       4       0       0       
    54 C       4       10.6989 10      10      0       0       0       0.00310627      0       0       3       5       0       0       
    55 C       5       12.3033 10      10      0       0       0       -0.00407466     0       0       4       0       0       0       
     51C       1       5.90296 10      10      0       0       0       -0.00220138     0       0       2       0       0       0       
     52C       2       7.4988  10      10      0       0       0       0.00074614      0       0       1       3       0       0       
     53C       3       9.09605 10      10      0       0       0       0.00296339      0       0       2       4       0       0       
     54C       4       10.6989 10      10      0       0       0       0.000820225     0       0       3       5       0       0       
     55C       5       12.3033 10      10      0       0       0       -0.00232838     0       0       4       0       0       0       
    5656# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    57 C       1       5.90167 10      10      0       0       0       -0.00220138     0       0       2       0       0       0       
    58 C       2       7.49933 10      10      0       0       0       0.00074614      0       0       1       3       0       0       
    59 C       3       9.0975  10      10      0       0       0       0.00296339      0       0       2       4       0       0       
    60 C       4       10.6996 10      10      0       0       0       0.000820225     0       0       3       5       0       0       
    61 C       5       12.302  10      10      0       0       0       -0.00232838     0       0       4       0       0       0       
     57C       1       5.90167 10      10      0       0       0       -0.00123827     0       0       2       0       0       0       
     58C       2       7.49933 10      10      0       0       0       0.00026988      0       0       1       3       0       0       
     59C       3       9.0975  10      10      0       0       0       0.00207967      0       0       2       4       0       0       
     60C       4       10.6996 10      10      0       0       0       0.000158753     0       0       3       5       0       0       
     61C       5       12.302  10      10      0       0       0       -0.00127003     0       0       4       0       0       0       
    6262# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    63 C       1       5.90028 10      10      0       0       0       -0.00123827     0       0       2       0       0       0       
    64 C       2       7.49949 10      10      0       0       0       0.00026988      0       0       1       3       0       0       
    65 C       3       9.10006 10      10      0       0       0       0.00207967      0       0       2       4       0       0       
    66 C       4       10.6996 10      10      0       0       0       0.000158753     0       0       3       5       0       0       
    67 C       5       12.3006 10      10      0       0       0       -0.00127003     0       0       4       0       0       0       
     63C       1       5.90028 10      10      0       0       0       -0.00041805     0       0       2       0       0       0       
     64C       2       7.49949 10      10      0       0       0       0.000719681     0       0       1       3       0       0       
     65C       3       9.10006 10      10      0       0       0       -0.000545053    0       0       2       4       0       0       
     66C       4       10.6996 10      10      0       0       0       0.000772599     0       0       3       5       0       0       
     67C       5       12.3006 10      10      0       0       0       -0.000529177    0       0       4       0       0       0       
    6868# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    69 C       1       5.90018 10      10      0       0       0       -0.00041805     0       0       2       0       0       0       
    70 C       2       7.49988 10      10      0       0       0       0.000719681     0       0       1       3       0       0       
    71 C       3       9.09986 10      10      0       0       0       -0.000545053    0       0       2       4       0       0       
    72 C       4       10.6998 10      10      0       0       0       0.000772599     0       0       3       5       0       0       
    73 C       5       12.3003 10      10      0       0       0       -0.000529177    0       0       4       0       0       0       
     69C       1       5.90018 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       2       0       0       0       
     70C       2       7.49988 10      10      0       0       0       0.00014817      0       0       1       3       0       0       
     71C       3       9.09986 10      10      0       0       0       -2.11671e-05    0       0       2       4       0       0       
     72C       4       10.6998 10      10      0       0       0       0.000296339     0       0       3       5       0       0       
     73C       5       12.3003 10      10      0       0       0       -0.000264589    0       0       4       0       0       0       
    7474# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    75 C       1       5.90014 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       2       0       0       0       
    76 C       2       7.49996 10      10      0       0       0       0.00014817      0       0       1       3       0       0       
    77 C       3       9.09987 10      10      0       0       0       -2.11671e-05    0       0       2       4       0       0       
    78 C       4       10.6999 10      10      0       0       0       0.000296339     0       0       3       5       0       0       
    79 C       5       12.3002 10      10      0       0       0       -0.000264589    0       0       4       0       0       0       
     75C       1       5.90014 10      10      0       0       0       -9.52519e-05    0       0       2       0       0       0       
     76C       2       7.49996 10      10      0       0       0       4.7626e-05      0       0       1       3       0       0       
     77C       3       9.09987 10      10      0       0       0       6.35013e-05     0       0       2       4       0       0       
     78C       4       10.6999 10      10      0       0       0       0.000142878     0       0       3       5       0       0       
     79C       5       12.3002 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       4       0       0       0       
    8080# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    81 C       1       5.90011 10      10      0       0       0       -9.52519e-05    0       0       2       0       0       0       
    82 C       2       7.5     10      10      0       0       0       4.7626e-05      0       0       1       3       0       0       
    83 C       3       9.09989 10      10      0       0       0       6.35013e-05     0       0       2       4       0       0       
    84 C       4       10.7    10      10      0       0       0       0.000142878     0       0       3       5       0       0       
    85 C       5       12.3001 10      10      0       0       0       -0.000158753    0       0       4       0       0       0       
     81C       1       5.90011 10      10      0       0       0       -5.82095e-05    0       0       2       0       0       0       
     82C       2       7.5     10      10      0       0       0       0       0       0       1       3       0       0       
     83C       3       9.09989 10      10      0       0       0       0.000116419     0       0       2       4       0       0       
     84C       4       10.7    10      10      0       0       0       -5.29177e-06    0       0       3       5       0       0       
     85C       5       12.3001 10      10      0       0       0       -5.29177e-05    0       0       4       0       0       0       
    8686# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    87 C       1       5.90008 10      10      0       0       0       -5.82095e-05    0       0       2       0       0       0       
    88 C       2       7.5     10      10      0       0       0       0       0       0       1       3       0       0       
    89 C       3       9.09993 10      10      0       0       0       0.000116419     0       0       2       4       0       0       
    90 C       4       10.7    10      10      0       0       0       -5.29177e-06    0       0       3       5       0       0       
    91 C       5       12.3    10      10      0       0       0       -5.29177e-05    0       0       4       0       0       0       
     87C       1       5.90008 10      10      0       0       0       -4.23342e-05    0       0       2       0       0       0       
     88C       2       7.5     10      10      0       0       0       5.29177e-06     0       0       1       3       0       0       
     89C       3       9.09993 10      10      0       0       0       7.40848e-05     0       0       2       4       0       0       
     90C       4       10.7    10      10      0       0       0       -3.70424e-05    0       0       3       5       0       0       
     91C       5       12.3    10      10      0       0       0       1.35525e-21     0       0       4       0       0       0       
    9292# ATOMDATA      type    Id      x=3     u=3     F=3     neighbors=4
    93 C       1       5.90004 10      10      0       0       0       -4.23342e-05    0       0       2       0       0       0       
    94 C       2       7.50001 10      10      0       0       0       5.29177e-06     0       0       1       3       0       0       
    95 C       3       9.09999 10      10      0       0       0       7.40848e-05     0       0       2       4       0       0       
    96 C       4       10.6999 10      10      0       0       0       -3.70424e-05    0       0       3       5       0       0       
    97 C       5       12.3    10      10      0       0       0       1.35525e-21     0       0       4       0       0       0       
     93C       1       5.90004 10      10      0       0       0       0       0       0       2       0       0       0       
     94C       2       7.50001 10      10      0       0       0       0       0       0       1       3       0       0       
     95C       3       9.09999 10      10      0       0       0       0       0       0       2       4       0       0       
     96C       4       10.6999 10      10      0       0       0       0       0       0       3       5       0       0       
     97C       5       12.3    10      10      0       0       0       0       0       0       4       0       0       0       
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.