Ignore:
File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • src/Makefile.am

    r6f646d r920c70  
     1# PLEASE adhere to the alphabetical ordering in this Makefile!
     2# Also indentation by a single tab
     3
     4SUBDIRS = Actions UIElements
     5
    16# this includes source files that need to be present at multiple points
    2 HELPERSOURCE =  Helpers/Assert.cpp \
    3                                 Helpers/MemDebug.cpp
     7HELPERSOURCE =  \
     8  Helpers/Assert.cpp \
     9  Helpers/MemDebug.cpp
    410                       
    5 ATOMSOURCE = atom.cpp atom_atominfo.cpp atom_bondedparticle.cpp atom_bondedparticleinfo.cpp atom_graphnode.cpp atom_graphnodeinfo.cpp atom_particleinfo.cpp atom_trajectoryparticle.cpp atom_trajectoryparticleinfo.cpp
    6 ATOMHEADER = atom.hpp atom_atominfo.hpp atom_bondedparticle.hpp atom_bondedparticleinfo.hpp atom_graphnode.hpp atom_graphnodeinfo.hpp atom_particleinfo.hpp atom_trajectoryparticle.hpp atom_trajectoryparticleinfo.hpp
    7 
    8 LINALGSOURCE = ${HELPERSOURCE} \
    9                gslmatrix.cpp \
    10                            gslvector.cpp \
    11                            linearsystemofequations.cpp \
    12                            Space.cpp \
    13                            vector.cpp
     11ATOMSOURCE = \
     12  atom.cpp \
     13  atom_atominfo.cpp \
     14  atom_bondedparticle.cpp \
     15  atom_bondedparticleinfo.cpp \
     16  atom_graphnode.cpp \
     17  atom_graphnodeinfo.cpp \
     18  atom_particleinfo.cpp \
     19  atom_trajectoryparticle.cpp \
     20  atom_trajectoryparticleinfo.cpp
     21ATOMHEADER = \
     22  atom.hpp \
     23  atom_atominfo.hpp \
     24  atom_bondedparticle.hpp \
     25  atom_bondedparticleinfo.hpp \
     26  atom_graphnode.hpp \
     27  atom_graphnodeinfo.hpp \
     28  atom_particleinfo.hpp \
     29  atom_trajectoryparticle.hpp \
     30  atom_trajectoryparticleinfo.hpp
     31
     32LINALGSOURCE = \
     33  ${HELPERSOURCE} \
     34  gslmatrix.cpp \
     35  gslvector.cpp \
     36  linearsystemofequations.cpp \
     37  Space.cpp \
     38  vector.cpp
    1439                           
    1540LINALGHEADER = gslmatrix.hpp \
    16                            gslvector.hpp \
    17                            linearsystemofequations.hpp \
    18                            Space.hpp \
    19                            vector.hpp
     41  gslvector.hpp \
     42  linearsystemofequations.hpp \
     43  Space.hpp \
     44  vector.hpp
    2045                           
    21 
    22 ANALYSISSOURCE = analysis_bonds.cpp analysis_correlation.cpp
    23 ANALYSISHEADER = analysis_bonds.hpp analysis_correlation.hpp
    24 
    25 ACTIONSSOURCE = Actions/Action.cpp \
    26                                 Actions/ActionHistory.cpp \
    27                                 Actions/ActionRegistry.cpp \
    28                                 Actions/ActionSequence.cpp \
    29                                 Actions/ErrorAction.cpp \
    30                                 Actions/MakroAction.cpp \
    31                                 Actions/ManipulateAtomsProcess.cpp \
    32                                 Actions/MethodAction.cpp \
    33                 Actions/Process.cpp \
    34                 Actions/small_actions.cpp
    35                
    36                  
    37 ACTIONSHEADER = Actions/Action.hpp \
    38                                 Actions/ActionHistory.hpp \
    39                                 Actions/ActionRegistry.hpp \
    40                                 Actions/ActionSequence.hpp \
    41                             Actions/Calculation.hpp \
    42                             Actions/Calculation_impl.hpp \
    43                             Actions/ErrorAction.hpp \
    44                             Actions/MakroAction.hpp \
    45                             Actions/ManipulateAtomsProcess.hpp \
    46                             Actions/MethodAction.hpp \
    47                             Actions/Process.hpp \
    48                             Actions/small_actions.hpp
    49                            
    50                            
    51 
    52 PATTERNSOURCE = Patterns/Observer.cpp
    53 PATTERNHEADER = Patterns/Cacheable.hpp \
    54                                 Patterns/Observer.hpp \
    55                 Patterns/Singleton.hpp
    56 
    57 VIEWSOURCE = Views/View.cpp Views/StringView.cpp Views/MethodStringView.cpp Views/StreamStringView.cpp
    58 VIEWHEADER = Views/View.hpp Views/StringView.hpp Views/MethodStringView.hpp Views/StreamStringView.hpp
    59 
    60 MENUSOURCE = Menu/Menu.cpp Menu/TextMenu.cpp Menu/MenuItem.cpp Menu/SubMenuItem.cpp Menu/ActionMenuItem.cpp Menu/SeperatorItem.cpp Menu/DisplayMenuItem.cpp
    61 MENUHEADER = Menu/Menu.hpp Menu/TextMenu.hpp Menu/MenuItem.hpp Menu/SubMenuItem.hpp Menu/ActionMenuItem.hpp Menu/SeperatorItem.hpp Menu/DisplayMenuItem.hpp
    62 
    63 UISOURCE = ${ACTIONSSOURCE} ${VIEWSOURCE} ${MENUSOURCE} UIElements/UIFactory.cpp UIElements/TextUIFactory.cpp UIElements/MainWindow.cpp UIElements/TextWindow.cpp UIElements/TextStatusIndicator.cpp UIElements/Dialog.cpp UIElements/TextDialog.cpp
    64 UIHEADER = ${ACTIONSHEADER} ${VIEWHEADER} ${MENUHEADER} UIElements/UIFactory.hpp UIElements/TextUIFactory.hpp UIElements/MainWindow.hpp UIElements/TextWindow.hpp UIElements/TextStatusIndicator.hpp UIElements/Dialog.hpp UIElements/TextDialog.hpp
     46ANALYSISSOURCE = \
     47  analysis_bonds.cpp \
     48  analysis_correlation.cpp
     49ANALYSISHEADER = \
     50  analysis_bonds.hpp \
     51  analysis_correlation.hpp
     52
     53ACTIONSSOURCE = \
     54  Actions/Action.cpp \
     55  Actions/ActionHistory.cpp \
     56  Actions/ActionRegistry.cpp \
     57  Actions/ActionSequence.cpp \
     58  Actions/ErrorAction.cpp \
     59  Actions/MakroAction.cpp \
     60  Actions/ManipulateAtomsProcess.cpp \
     61  Actions/MethodAction.cpp \
     62  Actions/Process.cpp
     63
     64ACTIONSHEADER = \
     65  ${ANALYSISACTIONHEADER} \
     66  ${ATOMACTIONHEADER} \
     67  ${CMDACTIONHEADER} \
     68  ${FRAGMENTATIONACTIONHEADER} \
     69  ${MOLECULEACTIONHEADER} \
     70  ${PARSERACTIONHEADER} \
     71  ${TESSELATIONACTIONHEADER} \
     72  ${WORLDACTIONHEADER} \
     73  Actions/Action.hpp \
     74  Actions/ActionHistory.hpp \
     75  Actions/ActionRegistry.hpp \
     76  Actions/ActionSequence.hpp \
     77  Actions/Calculation.hpp \
     78  Actions/Calculation_impl.hpp \
     79  Actions/ErrorAction.hpp \
     80  Actions/MakroAction.hpp \
     81  Actions/ManipulateAtomsProcess.hpp \
     82  Actions/MapOfActions.hpp \
     83  Actions/MethodAction.hpp \
     84  Actions/Process.hpp
     85 
     86
     87PARSERSOURCE = \
     88  Parser/ChangeTracker.cpp \
     89  Parser/FormatParser.cpp \
     90  Parser/TremoloParser.cpp \
     91  Parser/XyzParser.cpp
     92PARSERHEADER = \
     93  Parser/ChangeTracker.hpp \
     94  Parser/FormatParser.hpp \
     95  Parser/TremoloParser.hpp \
     96  Parser/XyzParser.hpp
     97
     98PATTERNSOURCE = \
     99  Patterns/Observer.cpp
     100PATTERNHEADER = \
     101  Patterns/Cacheable.hpp \
     102  Patterns/Observer.hpp \
     103  Patterns/Singleton.hpp
    65104
    66105# all these files are only used for legacy reasons while the transition is in progress
    … …  
    71110
    72111DESCRIPTORSOURCE = Descriptors/AtomDescriptor.cpp \
    73                                    Descriptors/AtomIdDescriptor.cpp \
    74                                    Descriptors/AtomTypeDescriptor.cpp \
    75                                    Descriptors/MoleculeDescriptor.cpp \
    76                                    Descriptors/MoleculeIdDescriptor.cpp
     112  Descriptors/AtomIdDescriptor.cpp \
     113  Descriptors/AtomTypeDescriptor.cpp \
     114  Descriptors/MoleculeDescriptor.cpp \
     115  Descriptors/MoleculeIdDescriptor.cpp
    77116                                   
    78117                                   
    79118DESCRIPTORHEADER = Descriptors/AtomDescriptor.hpp \
    80                                    Descriptors/AtomIdDescriptor.hpp \
    81                                    Descriptors/AtomTypeDescriptor.hpp \
    82                                    Descriptors/MoleculeDescriptor.hpp \
    83                                    Descriptors/MoleculeIdDescriptor.hpp
     119  Descriptors/AtomIdDescriptor.hpp \
     120  Descriptors/AtomTypeDescriptor.hpp \
     121  Descriptors/MoleculeDescriptor.hpp \
     122  Descriptors/MoleculeIdDescriptor.hpp
    84123                                   
    85 
    86 
    87124EXCEPTIONSOURCE = Exceptions/CustomException.cpp \
    88                                   Exceptions/LinearDependenceException.cpp \
    89                                   Exceptions/MathException.cpp \
    90                                   Exceptions/ZeroVectorException.cpp
     125  Exceptions/LinearDependenceException.cpp \
     126  Exceptions/MathException.cpp \
     127  Exceptions/ZeroVectorException.cpp
    91128                                 
    92129EXCEPTIONHEADER = Exceptions/CustomException.hpp \
    93                                   Exceptions/LinearDependenceException.hpp \
    94                                   Exceptions/MathException.hpp \
    95                                   Exceptions/ZeroVectorException.hpp
    96 
    97 SOURCE = ${ANALYSISSOURCE} \
    98                  ${ATOMSOURCE} \
    99                  ${PATTERNSOURCE} \
    100                  ${UISOURCE} \
    101                  ${DESCRIPTORSOURCE} \
    102                  ${HELPERSOURCE} \
    103                  ${LEGACYSOURCE} \
    104                  ${EXCEPTIONSOURCE} \
    105                  bond.cpp \
    106                  bondgraph.cpp \
    107                  boundary.cpp \
    108                  config.cpp \
    109                  element.cpp \
    110                  ellipsoid.cpp \
    111                  errorlogger.cpp \
    112                  graph.cpp \
    113                  helpers.cpp \
    114                  info.cpp \
    115                  leastsquaremin.cpp \
    116                  Line.cpp \
    117                  linkedcell.cpp \
    118                  lists.cpp \
    119                  log.cpp \
    120                  logger.cpp \
    121                  memoryusageobserver.cpp \
    122                  moleculelist.cpp \
    123                  molecule.cpp \
    124                  molecule_dynamics.cpp \
    125                  molecule_fragmentation.cpp \
    126                  molecule_geometry.cpp \
    127                  molecule_graph.cpp \
    128                  molecule_pointcloud.cpp \
    129                  parser.cpp \
    130                  periodentafel.cpp \
    131                  Plane.cpp \
    132                  tesselation.cpp \
    133                  tesselationhelpers.cpp \
    134                  triangleintersectionlist.cpp \
    135                  verbose.cpp \
    136                  vector_ops.cpp \
    137                  World.cpp
     130  Exceptions/LinearDependenceException.hpp \
     131  Exceptions/MathException.hpp \
     132  Exceptions/ZeroVectorException.hpp
     133
     134SOURCE = \
     135  ${ANALYSISSOURCE} \
     136  ${ACTIONSSOURCE} \
     137  ${ATOMSOURCE} \
     138  ${PATTERNSOURCE} \
     139  ${PARSERSOURCE} \
     140  ${DESCRIPTORSOURCE} \
     141  ${HELPERSOURCE} \
     142  ${LEGACYSOURCE} \
     143  ${EXCEPTIONSOURCE} \
     144  bond.cpp \
     145  bondgraph.cpp \
     146  boundary.cpp \
     147  CommandLineParser.cpp \
     148  config.cpp \
     149  element.cpp \
     150  elements_db.cpp \
     151  ellipsoid.cpp \
     152  errorlogger.cpp \
     153  graph.cpp \
     154  helpers.cpp \
     155  info.cpp \
     156  leastsquaremin.cpp \
     157  Line.cpp \
     158  linkedcell.cpp \
     159  lists.cpp \
     160  log.cpp \
     161  logger.cpp \
     162  moleculelist.cpp \
     163  molecule.cpp \
     164  molecule_dynamics.cpp \
     165  molecule_fragmentation.cpp \
     166  molecule_geometry.cpp \
     167  molecule_graph.cpp \
     168  molecule_pointcloud.cpp \
     169  parser.cpp \
     170  periodentafel.cpp \
     171  Plane.cpp \
     172  tesselation.cpp \
     173  tesselationhelpers.cpp \
     174  triangleintersectionlist.cpp \
     175  verbose.cpp \
     176  vector_ops.cpp \
     177  World.cpp
    138178
    139179HEADER = \
    140           ${ANALYSISHEADER} \
    141           ${ATOMHEADER} \
    142           ${PATTERNHEADER} \
    143           ${UIHEADER} \
    144           ${DESCRIPTORHEADER} \
    145           ${EXCEPTIONHEADER} \
    146           ${LEGACYHEADER} \
    147           bond.hpp \
    148           bondgraph.hpp \
    149           boundary.hpp \
    150           config.hpp \
    151           defs.hpp \
    152           element.hpp \
    153           ellipsoid.hpp \
    154           errorlogger.hpp \
    155           graph.hpp \
    156           helpers.hpp \
    157           info.hpp \
    158           leastsquaremin.hpp \
    159           Line.hpp \
    160           linkedcell.hpp \
    161           lists.hpp \
    162           log.hpp \
    163           logger.hpp \
    164           memoryallocator.hpp \
    165           memoryusageobserver.hpp \
    166           molecule.hpp \
    167           molecule_template.hpp \
    168           parser.hpp \
    169           periodentafel.hpp \
    170           Plane.hpp \
    171           stackclass.hpp \
    172           tesselation.hpp \
    173           tesselationhelpers.hpp \
    174           triangleintersectionlist.hpp \
    175           verbose.hpp \
    176           vector_ops.hpp \
    177           World.hpp
     180  ${ANALYSISHEADER} \
     181  ${ACTIONSHEADER} \
     182  ${ATOMHEADER} \
     183  ${PARSERHEADER} \
     184  ${PATTERNHEADER} \
     185  ${DESCRIPTORHEADER} \
     186  ${EXCEPTIONHEADER} \
     187  ${LEGACYHEADER} \
     188  bond.hpp \
     189  bondgraph.hpp \
     190  boundary.hpp \
     191  CommandLineParser.hpp \
     192  config.hpp \
     193  defs.hpp \
     194  element.hpp \
     195  elements_db.hpp \
     196  ellipsoid.hpp \
     197  errorlogger.hpp \
     198  graph.hpp \
     199  helpers.hpp \
     200  info.hpp \
     201  leastsquaremin.hpp \
     202  Line.hpp \
     203  linkedcell.hpp \
     204  lists.hpp \
     205  log.hpp \
     206  logger.hpp \
     207  molecule.hpp \
     208  molecule_template.hpp \
     209  parser.hpp \
     210  periodentafel.hpp \
     211  Plane.hpp \
     212  stackclass.hpp \
     213  tesselation.hpp \
     214  tesselationhelpers.hpp \
     215  triangleintersectionlist.hpp \
     216  verbose.hpp \
     217  vector_ops.hpp \
     218  World.hpp
     219
     220# the following files are no longer used:
     221#  memoryallocator.hpp \
     222#  memoryusageobserver.hpp \
     223#  memoryusageobserver.cpp
    178224
    179225BOOST_LIB = $(BOOST_LDFLAGS) $(BOOST_MPL_LIB)
    180 INCLUDES = -I$(top_srcdir)/src/unittests
     226INCLUDES = -I$(top_srcdir)/src/unittests -I$(top_srcdir)/src/Actions -I$(top_srcdir)/src/UIElements
    181227
    182228noinst_LIBRARIES = libmolecuilder.a libgslwrapper.a
    … …  
    185231libmolecuilder_a_SOURCES = ${SOURCE} ${HEADER}
    186232libgslwrapper_a_SOURCES = ${LINALGSOURCE} ${LINALGHEADER}
    187 molecuilder_DATA = elements.db valence.db orbitals.db Hbonddistance.db Hbondangle.db
    188233molecuilder_LDFLAGS = $(BOOST_LDFLAGS)
    189234molecuilder_SOURCES = builder.cpp
    190 molecuilder_LDADD = libmolecuilder.a libgslwrapper.a $(BOOST_LIB) ${BOOST_THREAD_LIB}
     235molecuilder_LDADD =  UIElements/libMolecuilderUI.a Actions/libMolecuilderActions.a libmolecuilder.a libgslwrapper.a $(BOOST_LIB) ${BOOST_THREAD_LIB} ${BOOST_PROGRAM_OPTIONS_LIB}
    191236joiner_SOURCES = joiner.cpp datacreator.cpp parser.cpp datacreator.hpp helpers.hpp parser.hpp periodentafel.hpp
    192237joiner_LDADD = libmolecuilder.a $(BOOST_LIB) ${BOOST_THREAD_LIB}
    193238analyzer_SOURCES = analyzer.cpp datacreator.cpp parser.cpp helpers.hpp periodentafel.hpp parser.hpp datacreator.hpp
    194239analyzer_LDADD = libmolecuilder.a $(BOOST_LIB) ${BOOST_THREAD_LIB}
    195 
    196 #EXTRA_DIST = ${molecuilder_DATA}
    197240
    198241FORCE:
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.