Ignore:
Timestamp:
Apr 10, 2018, 6:43:11 AM (7 years ago)
Author:
Frederik Heber <frederik.heber@…>
Branches:
AutomationFragmentation_failures, Candidate_v1.6.1, ChemicalSpaceEvaluator, Enhanced_StructuralOptimization_continued, Exclude_Hydrogens_annealWithBondGraph, ForceAnnealing_with_BondGraph, ForceAnnealing_with_BondGraph_contraction-expansion, Gui_displays_atomic_force_velocity, PythonUI_with_named_parameters, StoppableMakroAction, TremoloParser_IncreasedPrecision
Children:
2bb3be
Parents:
216840
git-author:
Frederik Heber <frederik.heber@…> (06/27/17 21:10:02)
git-committer:
Frederik Heber <frederik.heber@…> (04/10/18 06:43:11)
Message:

ForceAnnealing no longer resets forces, AnalyseFragmentResults now sets forces.

  • before we added onto force vector in AnalyseFragmentResults.
  • if we do not reset forces in ForceAnnealing we can inspect the force components in the output file along the annealing run.
  • TESTFIX: data files for regression test AnalyseFragmentResults OBC and PBC changed because of modified way of resetting forces.
File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • tests/regression/Fragmentation/AnalyseFragmentationResults/post/LongRange/PBC/alkane-3.data

    r216840 r866dec  
    11# ATOMDATA      Id      type    x=3     u=3     F=3
    22# Box   20      0       0       0       20      0       0       0       20
    3 1       C       5.89    6.513   5.89    0       0       0       -0.00161434     -0.00490854     -1.10584e-13   
    4 2       C       7.139   5.63    5.89    0       0       0       -0.00299896     0.00787442      -1.51277e-13   
    5 3       H       5.89    7.142   5       0       0       0       -0.00213528     -0.000289904    0.00251064     
    6 4       H       5.89    7.142   6.78    0       0       0       -0.00213528     -0.000289904    -0.00251064     
    7 5       H       7.139   5       5       0       0       0       0.000254991     -0.000726836    0.00279816     
    8 6       H       7.139   5       6.78    0       0       0       0.000254991     -0.000726836    -0.00279816     
    9 7       C       8.388   6.513   5.89    0       0       0       -0.000234367    -0.0118817      -1.64909e-13   
    10 8       C       9.638   5.63    5.89    0       0       0       0.000234232     0.0115391       -1.55457e-13   
    11 9       H       8.388   7.142   5       0       0       0       -5.97387e-05    0.000821868     0.00242643     
    12 10      H       8.388   7.142   6.78    0       0       0       -5.97387e-05    0.000821868     -0.00242643     
    13 11      H       9.638   5       5       0       0       0       5.95858e-05     -0.000650729    0.00254668     
    14 12      H       9.638   5       6.78    0       0       0       5.95858e-05     -0.000650729    -0.00254668     
    15 13      C       10.887  6.513   5.89    0       0       0       0.00299486      -0.00822198     -1.35631e-13   
    16 14      C       12.136  5.63    5.89    0       0       0       0.0016146       0.00459057      -1.39484e-13   
    17 15      H       10.887  7.142   5       0       0       0       -0.00025431     0.000898036     0.00267787     
    18 16      H       10.887  7.142   6.78    0       0       0       -0.00025431     0.000898036     -0.00267787     
    19 17      H       12.136  5       5       0       0       0       0.00213567      0.000462277     0.00263267     
    20 18      H       12.136  5       6.78    0       0       0       0.00213567      0.000462277     -0.00263267     
    21 19      H       5       5.884   5.89    0       0       0       -0.000456201    0.00402573      -1.63115e-15   
    22 20      H       13.026  6.259   5.89    0       0       0       0.00045834      -0.00404705     -4.39943e-16   
     31       C       5.89    6.513   5.89    0       0       0       6.46255e-16     1.76251e-16     -1.76251e-16   
     42       C       7.139   5.63    5.89    0       0       0       -2.93752e-16    -1.46876e-16    -1.76251e-16   
     53       H       5.89    7.142   5       0       0       0       8.81257e-16     -5.87505e-17    1.17501e-16     
     64       H       5.89    7.142   6.78    0       0       0       -6.31568e-16    3.37815e-16     2.05627e-16     
     75       H       7.139   5       5       0       0       0       1.17501e-16     1.76251e-16     -4.11253e-16   
     86       H       7.139   5       6.78    0       0       0       -3.23128e-16    -0      3.23128e-16     
     97       C       8.388   6.513   5.89    0       0       0       -2.24721e-15    -1.17501e-16    -5.28754e-16   
     108       C       9.638   5.63    5.89    0       0       0       1.90939e-16     1.46876e-17     8.81257e-17     
     119       H       8.388   7.142   5       0       0       0       -1.99752e-15    -5.87505e-16    -1.76251e-16   
     1210      H       8.388   7.142   6.78    0       0       0       -1.32189e-16    7.78444e-16     1.11626e-15     
     1311      H       9.638   5       5       0       0       0       2.35002e-16     -2.35002e-16    -1.76251e-16   
     1412      H       9.638   5       6.78    0       0       0       -4.40629e-17    -2.93752e-17    -8.81257e-17   
     1513      C       10.887  6.513   5.89    0       0       0       1.17501e-15     -2.93752e-17    -0     
     1614      C       12.136  5.63    5.89    0       0       0       1.76251e-16     -3.52503e-16    5.87505e-17     
     1715      H       10.887  7.142   5       0       0       0       1.27782e-15     3.52503e-16     -2.93752e-16   
     1816      H       10.887  7.142   6.78    0       0       0       8.6657e-16      2.93752e-16     2.35002e-16     
     1917      H       12.136  5       5       0       0       0       2.93752e-17     -1.17501e-16    -0     
     2018      H       12.136  5       6.78    0       0       0       -0      -1.46876e-16    -0     
     2119      H       5       5.884   5.89    0       0       0       1.11626e-15     2.05627e-16     -8.81257e-17   
     2220      H       13.026  6.259   5.89    0       0       0       8.81257e-17     -1.46876e-16    1.90939e-16     
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.