Context Navigation

water-system_initial_steps.data@ 4fc0ea

Visit:

Candidate_v1.6.1 ChemicalSpaceEvaluator TremoloParser_IncreasedPrecision

Last change on this file since 4fc0ea was 4fc0ea, checked in by Frederik Heber <frederik.heber@…>, 7 years ago

TESTFIX: Changes to various regression and Python tests because of modified output precision.

basically needed to change all .data files diff'ed against in tests.
TESTS: Removed XFAIL from all tests marked earlier as such.
TESTS: for the MolecularDynamics integration tests the ekin files have slightly changed but only in the last digits (typical relative error of 1e-5 at most).

Property mode set to 100644

File size: 14.6 KB

Line
1	# ATOMDATA Id type x=3 u=3 F=3 neighbors=2
2	# Box 10 0 0 0 10 0 0 0 10
3	1 O 2.386666667 1.666666667 1.666666667 0 0 0 0 0 0 2 3
4	2 H 3.106666667 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 1 0
5	3 H 1.666666667 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 1 0
6	4 O 2.386666667 1.666666667 5 0 0 0 0 0 0 5 6
7	5 H 3.106666667 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 4 0
8	6 H 1.666666667 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 4 0
9	7 O 2.386666667 1.666666667 8.333333333 0 0 0 0 0 0 8 9
10	8 H 3.106666667 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 7 0
11	9 H 1.666666667 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 7 0
12	10 O 2.386666667 5 1.666666667 0 0 0 0 0 0 11 12
13	11 H 3.106666667 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 10 0
14	12 H 1.666666667 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 10 0
15	13 O 2.386666667 5 5 0 0 0 0 0 0 14 15
16	14 H 3.106666667 5 5.558 0 0 0 0 0 0 13 0
17	15 H 1.666666667 5 5.558 0 0 0 0 0 0 13 0
18	16 O 2.386666667 5 8.333333333 0 0 0 0 0 0 17 18
19	17 H 3.106666667 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 16 0
20	18 H 1.666666667 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 16 0
21	19 O 2.386666667 8.333333333 1.666666667 0 0 0 0 0 0 20 21
22	20 H 3.106666667 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 19 0
23	21 H 1.666666667 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 19 0
24	22 O 2.386666667 8.333333333 5 0 0 0 0 0 0 23 24
25	23 H 3.106666667 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 22 0
26	24 H 1.666666667 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 22 0
27	25 O 2.386666667 8.333333333 8.333333333 0 0 0 0 0 0 26 27
28	26 H 3.106666667 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 25 0
29	27 H 1.666666667 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 25 0
30	28 O 5.72 1.666666667 1.666666667 0 0 0 0 0 0 29 30
31	29 H 6.44 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 28 0
32	30 H 5 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 28 0
33	31 O 5.72 1.666666667 5 0 0 0 0 0 0 32 33
34	32 H 6.44 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 31 0
35	33 H 5 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 31 0
36	34 O 5.72 1.666666667 8.333333333 0 0 0 0 0 0 35 36
37	35 H 6.44 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 34 0
38	36 H 5 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 34 0
39	37 O 5.72 5 1.666666667 0 0 0 0 0 0 38 39
40	38 H 6.44 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 37 0
41	39 H 5 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 37 0
42	40 O 5.72 5 5 0 0 0 0 0 0 41 42
43	41 H 6.44 5 5.558 0 0 0 0 0 0 40 0
44	42 H 5 5 5.558 0 0 0 0 0 0 40 0
45	43 O 5.72 5 8.333333333 0 0 0 0 0 0 44 45
46	44 H 6.44 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 43 0
47	45 H 5 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 43 0
48	46 O 5.72 8.333333333 1.666666667 0 0 0 0 0 0 47 48
49	47 H 6.44 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 46 0
50	48 H 5 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 46 0
51	49 O 5.72 8.333333333 5 0 0 0 0 0 0 50 51
52	50 H 6.44 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 49 0
53	51 H 5 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 49 0
54	52 O 5.72 8.333333333 8.333333333 0 0 0 0 0 0 53 54
55	53 H 6.44 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 52 0
56	54 H 5 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 52 0
57	55 O 9.053333333 1.666666667 1.666666667 0 0 0 0 0 0 56 57
58	56 H 9.773333333 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 55 0
59	57 H 8.333333333 1.666666667 2.224666667 0 0 0 0 0 0 55 0
60	58 O 9.053333333 1.666666667 5 0 0 0 0 0 0 59 60
61	59 H 9.773333333 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 58 0
62	60 H 8.333333333 1.666666667 5.558 0 0 0 0 0 0 58 0
63	61 O 9.053333333 1.666666667 8.333333333 0 0 0 0 0 0 62 63
64	62 H 9.773333333 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 61 0
65	63 H 8.333333333 1.666666667 8.891333333 0 0 0 0 0 0 61 0
66	64 O 9.053333333 5 1.666666667 0 0 0 0 0 0 65 66
67	65 H 9.773333333 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 64 0
68	66 H 8.333333333 5 2.224666667 0 0 0 0 0 0 64 0
69	67 O 9.053333333 5 5 0 0 0 0 0 0 68 69
70	68 H 9.773333333 5 5.558 0 0 0 0 0 0 67 0
71	69 H 8.333333333 5 5.558 0 0 0 0 0 0 67 0
72	70 O 9.053333333 5 8.333333333 0 0 0 0 0 0 71 72
73	71 H 9.773333333 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 70 0
74	72 H 8.333333333 5 8.891333333 0 0 0 0 0 0 70 0
75	73 O 9.053333333 8.333333333 1.666666667 0 0 0 0 0 0 74 75
76	74 H 9.773333333 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 73 0
77	75 H 8.333333333 8.333333333 2.224666667 0 0 0 0 0 0 73 0
78	76 O 9.053333333 8.333333333 5 0 0 0 0 0 0 77 78
79	77 H 9.773333333 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 76 0
80	78 H 8.333333333 8.333333333 5.558 0 0 0 0 0 0 76 0
81	79 O 9.053333333 8.333333333 8.333333333 0 0 0 0 0 0 80 81
82	80 H 9.773333333 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 79 0
83	81 H 8.333333333 8.333333333 8.891333333 0 0 0 0 0 0 79 0
84	# ATOMDATA Id type x=3 u=3 F=3 neighbors=2
85	1 O 2.386666667 1.666666667 1.666666667 -1.997246889e-16 -3.55691333e-16 -0.0005547061447 -1.278523298e-14 -2.276282255e-14 -0.03549897444 2 3
86	2 H 3.106666667 1.666666667 2.224666667 0.008368844759 -3.856377236e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.554891301e-14 0.01774948722 1 0
87	3 H 1.666666667 1.666666667 2.224666667 -0.008368844759 -3.849817132e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.552246268e-14 0.01774948722 1 0
88	4 O 2.386666667 1.666666667 5 -2.243735318e-16 -3.571404991e-16 -0.0005547061447 -1.436266032e-14 -2.285556338e-14 -0.03549897444 5 6
89	5 H 3.106666667 1.666666667 5.558 0.008368844759 -3.839203029e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.547966661e-14 0.01774948722 4 0
90	6 H 1.666666667 1.666666667 5.558 -0.008368844759 -3.84399014e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.549896824e-14 0.01774948722 4 0
91	7 O 2.386666667 1.666666667 8.333333333 -2.248128252e-16 -3.569472075e-16 -0.0005547061447 -1.439077334e-14 -2.284319349e-14 -0.03549897444 8 9
92	8 H 3.106666667 1.666666667 8.891333333 0.008368844759 -3.841942343e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.549071153e-14 0.01774948722 7 0
93	9 H 1.666666667 1.666666667 8.891333333 -0.008368844759 -3.844318756e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.550029322e-14 0.01774948722 7 0
94	10 O 2.386666667 5 1.666666667 -1.963268889e-16 5.524596033e-16 -0.0005547061447 -1.256778736e-14 3.535520477e-14 -0.03549897444 11 12
95	11 H 3.106666667 5 2.224666667 0.008368844759 -3.338624811e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.346133524e-14 0.01774948722 10 0
96	12 H 1.666666667 5 2.224666667 -0.008368844759 -3.330183169e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.342729854e-14 0.01774948722 10 0
97	13 O 2.386666667 5 5 -1.984605997e-16 5.508339935e-16 -0.0005547061447 -1.270433632e-14 3.525117225e-14 -0.03549897444 14 15
98	14 H 3.106666667 5 5.558 0.008368844759 -3.321851548e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.339370544e-14 0.01774948722 13 0
99	15 H 1.666666667 5 5.558 -0.008368844759 -3.321154714e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.339089581e-14 0.01774948722 13 0
100	16 O 2.386666667 5 8.333333333 -2.321857823e-16 5.523175311e-16 -0.0005547061447 -1.486261311e-14 3.534611272e-14 -0.03549897444 17 18
101	17 H 3.106666667 5 8.891333333 0.008368844759 -3.339643059e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.346544081e-14 0.01774948722 16 0
102	18 H 1.666666667 5 8.891333333 -0.008368844759 -3.326909947e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.341410091e-14 0.01774948722 16 0
103	19 O 2.386666667 8.333333333 1.666666667 -2.362927274e-16 1.129552405e-15 -0.0005547061447 -1.512544117e-14 7.228683569e-14 -0.03549897444 20 21
104	20 H 3.106666667 8.333333333 2.224666667 0.008368844759 -3.332391643e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.343620311e-14 0.01774948722 19 0
105	21 H 1.666666667 8.333333333 2.224666667 -0.008368844759 -3.34399934e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.348300534e-14 0.01774948722 19 0
106	22 O 2.386666667 8.333333333 5 -2.056650116e-16 1.12955606e-15 -0.0005547061447 -1.316538987e-14 7.228706962e-14 -0.03549897444 23 24
107	23 H 3.106666667 8.333333333 5.558 0.008368844759 -3.331764859e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.343367591e-14 0.01774948722 22 0
108	24 H 1.666666667 8.333333333 5.558 -0.008368844759 -3.344684143e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.348576646e-14 0.01774948722 22 0
109	25 O 2.386666667 8.333333333 8.333333333 -1.947463291e-16 1.13196827e-15 -0.0005547061447 -1.246663786e-14 7.244144141e-14 -0.03549897444 26 27
110	26 H 3.106666667 8.333333333 8.891333333 0.008368844759 -3.358607042e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.354190359e-14 0.01774948722 25 0
111	27 H 1.666666667 8.333333333 8.891333333 -0.008368844759 -3.356128615e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.353191057e-14 0.01774948722 25 0
112	28 O 5.72 1.666666667 1.666666667 3.873237139e-16 -3.56852997e-16 -0.0005547061447 2.478351661e-14 -2.28371644e-14 -0.03549897444 29 30
113	29 H 6.44 1.666666667 2.224666667 0.008368844759 -3.849322481e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.552046824e-14 0.01774948722 28 0
114	30 H 5 1.666666667 2.224666667 -0.008368844759 -3.83843393e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.54765656e-14 0.01774948722 28 0
115	31 O 5.72 1.666666667 5 3.68679743e-16 -3.578589999e-16 -0.0005547061447 2.359037705e-14 -2.290154456e-14 -0.03549897444 32 33
116	32 H 6.44 1.666666667 5.558 0.008368844759 -3.83265041e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.545324645e-14 0.01774948722 31 0
117	33 H 5 1.666666667 5.558 -0.008368844759 -3.839138698e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.547940723e-14 0.01774948722 31 0
118	34 O 5.72 1.666666667 8.333333333 4.011327678e-16 -3.566660461e-16 -0.0005547061447 2.566724082e-14 -2.282520029e-14 -0.03549897444 35 36
119	35 H 6.44 1.666666667 8.891333333 0.008368844759 -3.837603809e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.547321856e-14 0.01774948722 34 0
120	36 H 5 1.666666667 8.891333333 -0.008368844759 -3.853119891e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.55357794e-14 0.01774948722 34 0
121	37 O 5.72 5 1.666666667 4.223622942e-16 5.510170153e-16 -0.0005547061447 2.702584559e-14 3.526288491e-14 -0.03549897444 38 39
122	38 H 6.44 5 2.224666667 0.008368844759 -3.321078845e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.33905899e-14 0.01774948722 37 0
123	39 H 5 5 2.224666667 -0.008368844759 -3.324832343e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.340572401e-14 0.01774948722 37 0
124	40 O 5.72 5 5 4.107093641e-16 5.528919359e-16 -0.0005547061447 2.628010468e-14 3.538287233e-14 -0.03549897444 41 42
125	41 H 6.44 5 5.558 0.008368844759 -3.34003147e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.346700689e-14 0.01774948722 40 0
126	42 H 5 5 5.558 -0.008368844759 -3.335638502e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.344929444e-14 0.01774948722 40 0
127	43 O 5.72 5 8.333333333 4.322374307e-16 5.530601452e-16 -0.0005547061447 2.765781483e-14 3.539363705e-14 -0.03549897444 44 45
128	44 H 6.44 5 8.891333333 0.008368844759 -3.344148577e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.348360706e-14 0.01774948722 43 0
129	45 H 5 5 8.891333333 -0.008368844759 -3.334191218e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.344345899e-14 0.01774948722 43 0
130	46 O 5.72 8.333333333 1.666666667 3.527002211e-16 1.131079331e-15 -0.0005547061447 2.256775157e-14 7.238455283e-14 -0.03549897444 47 48
131	47 H 6.44 8.333333333 2.224666667 0.008368844759 -3.352374875e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.351677549e-14 0.01774948722 46 0
132	48 H 5 8.333333333 2.224666667 -0.008368844759 -3.348251512e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.35001501e-14 0.01774948722 46 0
133	49 O 5.72 8.333333333 5 4.024389933e-16 1.130557614e-15 -0.0005547061447 2.575083403e-14 7.235116507e-14 -0.03549897444 50 51
134	50 H 6.44 8.333333333 5.558 0.008368844759 -3.342853722e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.347838621e-14 0.01774948722 49 0
135	51 H 5 8.333333333 5.558 -0.008368844759 -3.349491971e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.350515163e-14 0.01774948722 49 0
136	52 O 5.72 8.333333333 8.333333333 4.044722942e-16 1.130969176e-15 -0.0005547061447 2.588095716e-14 7.237750339e-14 -0.03549897444 53 54
137	53 H 6.44 8.333333333 8.891333333 0.008368844759 -3.344749329e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.348602929e-14 0.01774948722 52 0
138	54 H 5 8.333333333 8.891333333 -0.008368844759 -3.354128683e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.352384685e-14 0.01774948722 52 0
139	55 O 9.053333333 1.666666667 1.666666667 -1.62160808e-15 -3.555639294e-16 -0.0005547061447 -1.037800825e-13 -2.275466923e-14 -0.03549897444 56 57
140	56 H 9.773333333 1.666666667 2.224666667 0.008368844759 -3.867525325e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.559386211e-14 0.01774948722 55 0
141	57 H 8.333333333 1.666666667 2.224666667 -0.008368844759 -3.840691196e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.54856669e-14 0.01774948722 55 0
142	58 O 9.053333333 1.666666667 5 -1.646361815e-15 -3.567492875e-16 -0.0005547061447 -1.053642225e-13 -2.28305274e-14 -0.03549897444 59 60
143	59 H 9.773333333 1.666666667 5.558 0.008368844759 -3.846472516e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.550897719e-14 0.01774948722 58 0
144	60 H 8.333333333 1.666666667 5.558 -0.008368844759 -3.842929974e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.549469366e-14 0.01774948722 58 0
145	61 O 9.053333333 1.666666667 8.333333333 -1.607477176e-15 -3.567044484e-16 -0.0005547061447 -1.028757612e-13 -2.282765788e-14 -0.03549897444 62 63
146	62 H 9.773333333 1.666666667 8.891333333 0.008368844759 -3.848928587e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.551888006e-14 0.01774948722 61 0
147	63 H 8.333333333 1.666666667 8.891333333 -0.008368844759 -3.841185589e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.54876603e-14 0.01774948722 61 0
148	64 O 9.053333333 5 1.666666667 -1.595895071e-15 5.518275566e-16 -0.0005547061447 -1.021345528e-13 3.531475631e-14 -0.03549897444 65 66
149	65 H 9.773333333 5 2.224666667 0.008368844759 -3.331911714e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.343426803e-14 0.01774948722 64 0
150	66 H 8.333333333 5 2.224666667 -0.008368844759 -3.326864406e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.341391729e-14 0.01774948722 64 0
151	67 O 9.053333333 5 5 -1.583965117e-15 5.534974186e-16 -0.0005547061447 -1.013710834e-13 3.54216208e-14 -0.03549897444 68 69
152	68 H 9.773333333 5 5.558 0.008368844759 -3.343096656e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.347936572e-14 0.01774948722 67 0
153	69 H 8.333333333 5 5.558 -0.008368844759 -3.342183552e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.347568408e-14 0.01774948722 67 0
154	70 O 9.053333333 5 8.333333333 -1.579960375e-15 5.527658608e-16 -0.0005547061447 -1.01114796e-13 3.537480403e-14 -0.03549897444 71 72
155	71 H 9.773333333 5 8.891333333 0.008368844759 -3.337080344e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.345510795e-14 0.01774948722 70 0
156	72 H 8.333333333 5 8.891333333 -0.008368844759 -3.336588563e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.345312508e-14 0.01774948722 70 0
157	73 O 9.053333333 8.333333333 1.666666667 -1.620406747e-15 1.1318638e-15 -0.0005547061447 -1.03703202e-13 7.243475574e-14 -0.03549897444 74 75
158	74 H 9.773333333 8.333333333 2.224666667 0.008368844759 -3.361304701e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.355278055e-14 0.01774948722 73 0
159	75 H 8.333333333 8.333333333 2.224666667 -0.008368844759 -3.351772804e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.351434795e-14 0.01774948722 73 0
160	76 O 9.053333333 8.333333333 5 -1.616329387e-15 1.130054846e-15 -0.0005547061447 -1.034422672e-13 7.231898994e-14 -0.03549897444 77 78
161	77 H 9.773333333 8.333333333 5.558 0.008368844759 -3.33993359e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.346661223e-14 0.01774948722 76 0
162	78 H 8.333333333 8.333333333 5.558 -0.008368844759 -3.34443216e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.348475047e-14 0.01774948722 76 0
163	79 O 9.053333333 8.333333333 8.333333333 -1.558992632e-15 1.13241126e-15 -0.0005547061447 -9.977294425e-14 7.246979101e-14 -0.03549897444 80 81
164	80 H 9.773333333 8.333333333 8.891333333 0.008368844759 -3.363003736e-15 0.004402154568 0.03374318207 -1.355963107e-14 0.01774948722 79 0
165	81 H 8.333333333 8.333333333 8.891333333 -0.008368844759 -3.358763072e-15 0.004402154568 -0.03374318207 -1.354253271e-14 0.01774948722 79 0

Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.

Download in other formats:

Original Format