| 1 | /* | 
|---|
| 2 | * atom_atominfo.cpp | 
|---|
| 3 | * | 
|---|
| 4 | *  Created on: Oct 19, 2009 | 
|---|
| 5 | *      Author: heber | 
|---|
| 6 | */ | 
|---|
| 7 |  | 
|---|
| 8 | #include "Helpers/MemDebug.hpp" | 
|---|
| 9 |  | 
|---|
| 10 | #include "periodentafel.hpp" | 
|---|
| 11 | #include "World.hpp" | 
|---|
| 12 | #include "element.hpp" | 
|---|
| 13 | #include "atom_atominfo.hpp" | 
|---|
| 14 |  | 
|---|
| 15 | /** Constructor of class AtomInfo. | 
|---|
| 16 | */ | 
|---|
| 17 | AtomInfo::AtomInfo() : | 
|---|
| 18 | AtomicElement(NULL) | 
|---|
| 19 | {}; | 
|---|
| 20 |  | 
|---|
| 21 | /** Copy constructor of class AtomInfo. | 
|---|
| 22 | */ | 
|---|
| 23 | AtomInfo::AtomInfo(const AtomInfo &_atom) : | 
|---|
| 24 | AtomicPosition(_atom.AtomicPosition), | 
|---|
| 25 | AtomicElement(_atom.AtomicElement) | 
|---|
| 26 | {}; | 
|---|
| 27 |  | 
|---|
| 28 | AtomInfo::AtomInfo(const VectorInterface &_v) : | 
|---|
| 29 | AtomicPosition(_v.getPosition()), | 
|---|
| 30 | AtomicElement(NULL) | 
|---|
| 31 | {}; | 
|---|
| 32 |  | 
|---|
| 33 | /** Destructor of class AtomInfo. | 
|---|
| 34 | */ | 
|---|
| 35 | AtomInfo::~AtomInfo() | 
|---|
| 36 | { | 
|---|
| 37 | }; | 
|---|
| 38 |  | 
|---|
| 39 | const element *AtomInfo::getType() const | 
|---|
| 40 | { | 
|---|
| 41 | return AtomicElement; | 
|---|
| 42 | } | 
|---|
| 43 |  | 
|---|
| 44 | const double& AtomInfo::operator[](size_t i) const | 
|---|
| 45 | { | 
|---|
| 46 | return AtomicPosition[i]; | 
|---|
| 47 | } | 
|---|
| 48 |  | 
|---|
| 49 | const double& AtomInfo::at(size_t i) const | 
|---|
| 50 | { | 
|---|
| 51 | return AtomicPosition.at(i); | 
|---|
| 52 | } | 
|---|
| 53 |  | 
|---|
| 54 | void AtomInfo::set(size_t i, const double value) | 
|---|
| 55 | { | 
|---|
| 56 | AtomicPosition.at(i) = value; | 
|---|
| 57 | } | 
|---|
| 58 |  | 
|---|
| 59 | const Vector& AtomInfo::getPosition() const | 
|---|
| 60 | { | 
|---|
| 61 | return AtomicPosition; | 
|---|
| 62 | } | 
|---|
| 63 |  | 
|---|
| 64 | void AtomInfo::setType(const element* _type) { | 
|---|
| 65 | AtomicElement = _type; | 
|---|
| 66 | } | 
|---|
| 67 |  | 
|---|
| 68 | void AtomInfo::setType(const int Z) { | 
|---|
| 69 | const element *elem = World::getInstance().getPeriode()->FindElement(Z); | 
|---|
| 70 | setType(elem); | 
|---|
| 71 | } | 
|---|
| 72 |  | 
|---|
| 73 | void AtomInfo::setPosition(const Vector& _vector) | 
|---|
| 74 | { | 
|---|
| 75 | AtomicPosition = _vector; | 
|---|
| 76 | //cout << "AtomInfo::setPosition: " << getType()->symbol << " at " << getPosition() << endl; | 
|---|
| 77 | } | 
|---|
| 78 |  | 
|---|
| 79 | const VectorInterface& AtomInfo::operator+=(const Vector& b) | 
|---|
| 80 | { | 
|---|
| 81 | AtomicPosition += b; | 
|---|
| 82 | return *this; | 
|---|
| 83 | } | 
|---|
| 84 |  | 
|---|
| 85 | const VectorInterface& AtomInfo::operator-=(const Vector& b) | 
|---|
| 86 | { | 
|---|
| 87 | AtomicPosition -= b; | 
|---|
| 88 | return *this; | 
|---|
| 89 | } | 
|---|
| 90 |  | 
|---|
| 91 | Vector const AtomInfo::operator+(const Vector& b) const | 
|---|
| 92 | { | 
|---|
| 93 | Vector a(AtomicPosition); | 
|---|
| 94 | a += b; | 
|---|
| 95 | return a; | 
|---|
| 96 | } | 
|---|
| 97 |  | 
|---|
| 98 | Vector const AtomInfo::operator-(const Vector& b) const | 
|---|
| 99 | { | 
|---|
| 100 | Vector a(AtomicPosition); | 
|---|
| 101 | a -= b; | 
|---|
| 102 | return a; | 
|---|
| 103 | } | 
|---|
| 104 |  | 
|---|
| 105 | double AtomInfo::distance(const Vector &point) const | 
|---|
| 106 | { | 
|---|
| 107 | return AtomicPosition.distance(point); | 
|---|
| 108 | } | 
|---|
| 109 |  | 
|---|
| 110 | double AtomInfo::DistanceSquared(const Vector &y) const | 
|---|
| 111 | { | 
|---|
| 112 | return AtomicPosition.DistanceSquared(y); | 
|---|
| 113 | } | 
|---|
| 114 |  | 
|---|
| 115 | double AtomInfo::distance(const VectorInterface &_atom) const | 
|---|
| 116 | { | 
|---|
| 117 | return _atom.distance(AtomicPosition); | 
|---|
| 118 | } | 
|---|
| 119 |  | 
|---|
| 120 | double AtomInfo::DistanceSquared(const VectorInterface &_atom) const | 
|---|
| 121 | { | 
|---|
| 122 | return _atom.DistanceSquared(AtomicPosition); | 
|---|
| 123 | } | 
|---|
| 124 |  | 
|---|
| 125 | VectorInterface &AtomInfo::operator=(const Vector& _vector) | 
|---|
| 126 | { | 
|---|
| 127 | AtomicPosition = _vector; | 
|---|
| 128 | return *this; | 
|---|
| 129 | } | 
|---|
| 130 |  | 
|---|
| 131 | void AtomInfo::ScaleAll(const double *factor) | 
|---|
| 132 | { | 
|---|
| 133 | AtomicPosition.ScaleAll(factor); | 
|---|
| 134 | } | 
|---|
| 135 |  | 
|---|
| 136 | void AtomInfo::ScaleAll(const Vector &factor) | 
|---|
| 137 | { | 
|---|
| 138 | AtomicPosition.ScaleAll(factor); | 
|---|
| 139 | } | 
|---|
| 140 |  | 
|---|
| 141 | void AtomInfo::Scale(const double factor) | 
|---|
| 142 | { | 
|---|
| 143 | AtomicPosition.Scale(factor); | 
|---|
| 144 | } | 
|---|
| 145 |  | 
|---|
| 146 | void AtomInfo::Zero() | 
|---|
| 147 | { | 
|---|
| 148 | AtomicPosition.Zero(); | 
|---|
| 149 | } | 
|---|
| 150 |  | 
|---|
| 151 | void AtomInfo::One(const double one) | 
|---|
| 152 | { | 
|---|
| 153 | AtomicPosition.One(one); | 
|---|
| 154 | } | 
|---|
| 155 |  | 
|---|
| 156 | void AtomInfo::LinearCombinationOfVectors(const Vector &x1, const Vector &x2, const Vector &x3, const double * const factors) | 
|---|
| 157 | { | 
|---|
| 158 | AtomicPosition.LinearCombinationOfVectors(x1,x2,x3,factors); | 
|---|
| 159 | } | 
|---|
| 160 |  | 
|---|
| 161 | const AtomInfo& operator*=(AtomInfo& a, const double m) | 
|---|
| 162 | { | 
|---|
| 163 | a.Scale(m); | 
|---|
| 164 | return a; | 
|---|
| 165 | } | 
|---|
| 166 |  | 
|---|
| 167 | AtomInfo const operator*(const AtomInfo& a, const double m) | 
|---|
| 168 | { | 
|---|
| 169 | AtomInfo copy(a); | 
|---|
| 170 | copy *= m; | 
|---|
| 171 | return copy; | 
|---|
| 172 | } | 
|---|
| 173 |  | 
|---|
| 174 | AtomInfo const operator*(const double m, const AtomInfo& a) | 
|---|
| 175 | { | 
|---|
| 176 | AtomInfo copy(a); | 
|---|
| 177 | copy *= m; | 
|---|
| 178 | return copy; | 
|---|
| 179 | } | 
|---|
| 180 |  | 
|---|
| 181 | std::ostream & AtomInfo::operator << (std::ostream &ost) const | 
|---|
| 182 | { | 
|---|
| 183 | return (ost << getPosition()); | 
|---|
| 184 | } | 
|---|
| 185 |  | 
|---|
| 186 | std::ostream & operator << (std::ostream &ost, const AtomInfo &a) | 
|---|
| 187 | { | 
|---|
| 188 | ost << a; | 
|---|
| 189 | return ost; | 
|---|
| 190 | } | 
|---|
| 191 |  | 
|---|